工程預算審計主要針對工程項目決算的，在一個建設項目竣工完成，建設單位與施工單位結算工程款時進行的。工程預算審計就是工程預算審核（審價），是工程預算咨詢單位咨詢業務的一部分。受業主委托對其工程項目的概算、預算及結算等，依據現行 政策法規、計價依據及相關工程技術資料對送審造價的工程量、單價及取費等進行逐項審核。在運用工程量清單計價模式進行工程預算審計工作時，可以從以下幾個方面來進行：

工程預算工作內容： 1.認真對照商務標清單，把全部清單工程量全部自己計算一遍，看看是否有誤差 2.認真對照商務標清單，把清單綜合單價和主材價與市場詢價做好對比，然后分析 3.進行分包時，要做法嚴格控制分包單位的清單工程量及價格 4.積極到現場去觀察，做好圖紙會審的工作，提出有利我方的變更簽證 5.相關工程進度款格式、月報格式、工程聯系單格式、現場經濟簽證格式等要從監理及甲方要取。 6.工程聯系單、現場經濟簽證單及索賠的編制切記要理由充分，論點鮮明，證據齊全，把原因全歸結于甲方、監理、設計院及其它因素，加大事情嚴重性及我方損失性，工程量適當加大。

工程預算隨著我國經濟的迅速發展 加強了基本建設力度在取得巨大成就的同時也出現了一些值得重視的問題。如某些施工單位為了追求自身的利益，在基建工程上營私舞弊，頻頻出現高估冒算的現象。根據以往工作經驗，進行工程決算審計常發現的問題有：多列工程項目、工程量不實、高套定額、亂取費用等問題。為了管理好并合理使用基建資金提高投資效益和維護建設方利益加強基建工程決算的審計工作非常重要。開展工程決算審計主要從以下幾個方面入手。

積極采用招投標的方法選擇設計單位，在合同中明確要求設計人員對投資問題的重視，比如，在合同中可以規定，如果樂山工程預算設計變更費用超出施工合同價的5%，就要扣除一定比例的設計費用。優化設計方案，控制工程造價。為了控制工程造價，設計人員要多拿出幾套設計方案由造價人員分析，造價人員要對其中涉及的影響因素從經濟角度進行深入分析，以實現投資小化。比如某市政排水管線工程，原擬定新建691m長的D1800管道，其中30m需要進行頂管施工。后來，經過實際勘察，決定改變原有的設計方案，將D1800管道的長度縮減為558m，且不需要頂管施工，終節省工程費用近100萬元[。改變收費方法。在收取設計費用方面，要積極引入限額按比例提成的方法，促使設計單位與建設單位一同成本控制意識，進而實現成本控制目標。在施工階段，對工程造價產生影響的因素會比較少，但是樂山工程預算由于該階段是工程實體形成的關鍵階段，如果控制不好，也會使得造價難以得到控制施工現場管理混亂。業主方缺乏一套系統完整的管理體系，各部門之間、各人員之間職責不清，協調不力。施工方造價文件保管不清、不全，在竣工結算時出現種種矛盾，使得工程造價失控。