目前市面上常用的碳源：甲醇、乙酸、乙酸鈉、面粉、葡萄糖、生物質碳源及污泥水解上清液等。在使用過程中，需要根據實際工程情況選擇合適的碳源。 甲醇作為外碳源具有運行費用低和污泥產量小的優勢，在甲醇碳源不足時，存在亞硝酸鹽積累的現象。以甲醇為碳源時的反硝化速率比以葡萄糖為碳源時快3倍，其 碳氮比（COD：氨氮）為 2.8～3.2 。 但甲醇作為外加碳源時，有以下3點問題需關注： 甲醇易燃，為甲類危化品，儲存和使用均有嚴格要求。特別是其儲存需報當地公安部門備案審批，手續繁瑣。

復合碳源 性能與用途： 本產品是一種、、快速、低耗、的小分子碳源補充劑，碳源補充劑的主要作用是去除總氮，兼具幾種外加碳源藥劑的優點，化學性質穩定，反硝化速率快，污泥產量低，污泥菌種適應快，脫氮效果好，處理成本低于其他幾種常規碳源藥劑，適用于污水廠的應急投加處理，滿足水質排放要求的同時達到 經濟效果，是一種穩定的低成本碳源補充劑。 微生物對甲醇的響應時間較慢，甲醇并不能被所有微生物利用，當甲醇用于污水處理廠應急投加碳源時效果不佳； 甲醇具有一定的毒害作用，將甲醇作為長期碳源，對尾水的排放也會造成一定的影響。 復合碳源 復合碳源, 含微生物促升劑, 含微生物微量元素, 更適合微生物生長和繁育, 更加的處理水中污染物, 在細胞體內進行反硝化時作為電子供體, NOx-N 為電子受體, 其生化途徑具有多條途徑, 不會受到某些途徑中關鍵酶的影響, 減少了碳源用于其它代謝途徑的損耗。